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教程
与anndata入门
将pytorch模型与anndata进行接口对接
惰性地连接多个AnnData对象
将pytorch模型与AnnData对象集合进行接口连接
Dask 数组支持到 AnnData
AnnData 中的尴尬数组
Dask + Zarr，但是远程！
API
anndata.AnnData
anndata.AnnData.T
anndata.AnnData.X
anndata.AnnData.filename
anndata.AnnData.is_view
anndata.AnnData.isbacked
anndata.AnnData.layers
anndata.AnnData.n_obs
anndata.AnnData.n_vars
anndata.AnnData.obs
anndata.AnnData.obs_names
anndata.AnnData.obsm
anndata.AnnData.obsp
anndata.AnnData.raw
anndata.AnnData.shape
anndata.AnnData.uns
anndata.AnnData.var
anndata.AnnData.var_names
anndata.AnnData.varm
anndata.AnnData.varp
anndata.AnnData.chunk_X
anndata.AnnData.chunked_X
anndata.AnnData.concatenate
anndata.AnnData.copy
anndata.AnnData.obs_keys
anndata.AnnData.obs_names_make_unique
anndata.AnnData.obs_vector
anndata.AnnData.obsm_keys
anndata.AnnData.rename_categories
anndata.AnnData.strings_to_categoricals
anndata.AnnData.to_df
anndata.AnnData.to_memory
anndata.AnnData.transpose
anndata.AnnData.uns_keys
anndata.AnnData.var_keys
anndata.AnnData.var_names_make_unique
anndata.AnnData.var_vector
anndata.AnnData.varm_keysNoneNone
anndata.AnnData.write
anndata.AnnData.write_csvs
anndata.AnnData.write_h5ad
anndata.AnnData.write_loom
anndata.AnnData.write_zarr
anndata.concat
anndata.io.read_h5ad
anndata.io.read_zarr
anndata.io.read_elem
anndata.io.sparse_dataset
anndata.io.read_csv
anndata.io.read_excel
anndata.io.read_hdf
anndata.io.read_loom
anndata.io.read_mtx
anndata.io.read_text
anndata.io.read_umi_tools
anndata.AnnData.write
anndata.AnnData.write_zarr
anndata.io.write_elem
anndata.AnnData.write_csvs
anndata.AnnData.write_loom
anndata.experimental.AnnCollection
anndata.experimental.AnnCollection.attrs_keys
anndata.experimental.AnnCollection.convert
anndata.experimental.AnnCollection.has_backed
anndata.experimental.AnnCollection.n_obs
anndata.experimental.AnnCollection.n_vars
anndata.experimental.AnnCollection.obs
anndata.experimental.AnnCollection.obsm
anndata.experimental.AnnCollection.shape
anndata.experimental.AnnCollection.iterate_axis
anndata.experimental.AnnCollection.lazy_attr
anndata.experimental.AnnCollection.to_adata
anndata.experimental.AnnLoader
anndata.experimental.concat_on_disk
anndata.experimental.read_elem_as_dask
anndata.experimental.read_dispatched
anndata.experimental.write_dispatched
anndata.experimental.IOSpec
anndata.experimental.IOSpec.encoding_type
anndata.experimental.IOSpec.encoding_version
anndata.experimental.Read
anndata.experimental.Write
anndata.experimental.ReadCallback
anndata.experimental.WriteCallback
anndata.experimental.StorageType
anndata.隐式修改警告
anndata.settings
anndata.settings.override
anndata.abc.CSRDataset
anndata.abc.CSRDataset.format
anndata.abc.CSRDataset.shape
anndata.abc.CSRDataset.dtype
anndata.abc.CSRDataset.backend
anndata.abc.CSRDataset.__getitem__
anndata.abc.CSRDataset.to_memory
anndata.abc.CSCDataset
anndata.abc.CSCDataset.format
anndata.abc.CSCDataset.shape
anndata.abc.CSCDataset.dtype
anndata.abc.CSCDataset.backend
anndata.abc.CSCDataset.__getitem__
anndata.abc.CSCDataset.to_memory
anndata.typing.Index
anndata.typing.AxisStorable
anndata.typing.RWAble
连接
磁盘上的格式
互操作性
基准测试
简单基准测试
贡献
发布说明
参考文献
.rst
.pdf
anndata.AnnData.shape
目录
AnnData.shape
anndata.AnnData.shape
#
property
AnnData.
shape
:
tuple
[
int
,
int
]
[source]
#
数据矩阵的形状 (
n_obs
,
n_vars
).
Contents
AnnData.shape
