互操作性#
anndata文件的磁盘表示可以从其他语言读取。这里列出了与AnnData交互的接口,供您选择的语言使用:
R#
zellkonverter zellkonverter 提供基于 basilisk 的工具,用于从
h5ad文件加载到SingleCellExperimentanndata 提供了
AnnData的 R 实现以及 HDF5 格式的 IO。MuData 为存储在 HDF5 中的
AnnData和MuData提供 IO 到 Bioconductor 的SingleCellExperiment和MultiAssayExperiment对象。MuDataSeurat 提供从
AnnData和MuData存储在 HDF5 中到Seurat对象的输入输出。
朱利亚#
Javascript#
Vitessce 包含存储为 Zarr 的
AnnData加载器,并利用此功能提供交互式可视化
镕锌#
anndata-rs 提供了
AnnData的 Rust 实现,并且支持 HDF5 存储格式的高级IO。