17.2.260. MPI_Neighbor_allgatherv
MPI_Neighbor_allgatherv, MPI_Ineighbor_allgatherv, MPI_Neighbor_allgatherv_init — 从所有邻居进程收集数据并向其分发数据。每个进程可以提供不同数量的数据。
17.2.260.1. 语法
17.2.260.1.1. C语言语法
#include <mpi.h>
int MPI_Neighbor_allgatherv(const void *sendbuf, int sendcount,
MPI_Datatype sendtype, void *recvbuf, const int recvcounts[],
const int displs[], MPI_Datatype recvtype, MPI_Comm comm)
int MPI_Ineighbor_allgatherv(const void *sendbuf, int sendcount,
MPI_Datatype sendtype, void *recvbuf, const int recvcounts[],
const int displs[], MPI_Datatype recvtype, MPI_Comm comm,
MPI_Request *request)
int MPI_Neighbor_allgatherv(const void *sendbuf, int sendcount,
MPI_Datatype sendtype, void *recvbuf, const int recvcounts[],
const int displs[], MPI_Datatype recvtype, MPI_Comm comm,
MPI_Info info, MPI_Request *request)
17.2.260.1.2. Fortran语法
USE MPI
! or the older form: INCLUDE 'mpif.h'
MPI_NEIGHBOR_ALLGATHERV(SENDBUF, SENDCOUNT, SENDTYPE, RECVBUF,
RECVCOUNT, DISPLS, RECVTYPE, COMM, IERROR)
<type> SENDBUF(*), RECVBUF(*)
INTEGER SENDCOUNT, SENDTYPE, RECVCOUNT(*),
INTEGER DISPLS(*), RECVTYPE, COMM, IERROR
MPI_INEIGHBOR_ALLGATHERV(SENDBUF, SENDCOUNT, SENDTYPE, RECVBUF,
RECVCOUNT, DISPLS, RECVTYPE, COMM, REQUEST, IERROR)
<type> SENDBUF(*), RECVBUF(*)
INTEGER SENDCOUNT, SENDTYPE, RECVCOUNT(*),
INTEGER DISPLS(*), RECVTYPE, COMM,REQUEST, IERROR
MPI_NEIGHBOR_ALLGATHERV_INIT(SENDBUF, SENDCOUNT, SENDTYPE, RECVBUF,
RECVCOUNT, DISPLS, RECVTYPE, COMM, INFO, REQUEST, IERROR)
<type> SENDBUF(*), RECVBUF(*)
INTEGER SENDCOUNT, SENDTYPE, RECVCOUNT(*),
INTEGER DISPLS(*), RECVTYPE, COMM,INFO,REQUEST, IERROR
17.2.260.1.3. Fortran 2008 语法
USE mpi_f08
MPI_Neighbor_allgatherv(sendbuf, sendcount, sendtype, recvbuf, recvcounts,
displs, recvtype, comm, ierror)
TYPE(*), DIMENSION(..), INTENT(IN) :: sendbuf
TYPE(*), DIMENSION(..) :: recvbuf
INTEGER, INTENT(IN) :: sendcount, recvcounts(*), displs(*)
TYPE(MPI_Datatype), INTENT(IN) :: sendtype, recvtype
TYPE(MPI_Comm), INTENT(IN) :: comm
INTEGER, OPTIONAL, INTENT(OUT) :: ierror
MPI_Ineighbor_allgatherv(sendbuf, sendcount, sendtype, recvbuf, recvcounts,
displs, recvtype, comm, request, ierror)
TYPE(*), DIMENSION(..), INTENT(IN), ASYNCHRONOUS :: sendbuf
TYPE(*), DIMENSION(..), ASYNCHRONOUS :: recvbuf
INTEGER, INTENT(IN) :: sendcount
INTEGER, INTENT(IN), ASYNCHRONOUS :: recvcounts(*), displs(*)
TYPE(MPI_Datatype), INTENT(IN) :: sendtype, recvtype
TYPE(MPI_Comm), INTENT(IN) :: comm
TYPE(MPI_Request), INTENT(OUT) :: request
INTEGER, OPTIONAL, INTENT(OUT) :: ierror
MPI_Neighbor_allgatherv_init(sendbuf, sendcount, sendtype, recvbuf, recvcounts,
displs, recvtype, comm, info, request, ierror)
TYPE(*), DIMENSION(..), INTENT(IN), ASYNCHRONOUS :: sendbuf
TYPE(*), DIMENSION(..), ASYNCHRONOUS :: recvbuf
INTEGER, INTENT(IN) :: sendcount
INTEGER, INTENT(IN), ASYNCHRONOUS :: recvcounts(*), displs(*)
TYPE(MPI_Datatype), INTENT(IN) :: sendtype, recvtype
TYPE(MPI_Comm), INTENT(IN) :: comm
TYPE(MPI_Info), INTENT(IN) :: info
TYPE(MPI_Request), INTENT(OUT) :: request
INTEGER, OPTIONAL, INTENT(OUT) :: ierror
17.2.260.2. 输入参数
sendbuf: 发送缓冲区的起始地址(选项)。sendcount: 发送缓冲区中的元素数量(整数)。sendtype: 发送缓冲区元素的数据类型(句柄)。recvcount: 整数数组(长度为组大小),包含从每个邻居接收的元素数量。displs: 整型数组(长度为组大小)。条目i指定从邻居i接收数据的位移(相对于recvbuf)。recvtype: 接收缓冲区元素的数据类型(句柄)。comm: 通信器(句柄)。info Info (handle, persistent only).:
17.2.260.3. 输出参数
recvbuf: 接收缓冲区的地址(选项)。request: 请求(句柄,仅限非阻塞模式)。ierror: 仅限Fortran:错误状态(整数)。
17.2.260.4. 描述
MPI_Neighbor_allgatherv 与 MPI_Neighbor_allgather 类似,都是所有进程从所有邻居处收集数据,区别在于每个进程可以发送不同数量的数据。从第j个邻居发送的数据块会被每个邻居接收,并放置在缓冲区的第j个块中。邻居关系和缓冲区布局由 comm 的拓扑结构决定。recvbuf.
进程j上与sendcount、sendtype关联的类型签名必须等于相邻进程上recvcounts中对应条目的类型签名。
17.2.260.5. 邻居排序
对于使用MPI_Dist_graph_create创建的分布式图拓扑结构,每个进程中发送和接收缓冲区内的邻居序列分别定义为MPI_Dist_graph_neighbors返回的目标节点和源节点序列。对于使用MPI_Graph_create创建的一般图拓扑结构,发送和接收缓冲区中的邻居顺序定义为MPI_Graph_neighbors返回的邻居序列。需要注意的是,通常应该用分布式图拓扑结构来替代一般图拓扑结构。
对于通过MPI_Cart_create创建的笛卡尔拓扑结构,每个进程中发送和接收缓冲区的邻居顺序由维度顺序定义:首先是负方向的邻居,然后是位移为1的正方向邻居。通信例程中的源和目标数量为2*ndims,其中ndims在MPI_Cart_create中定义。如果某个邻居不存在(例如在非周期性虚拟网格维度的笛卡尔拓扑边界处,即periods[…]==false时),则该邻居被定义为MPI_PROC_NULL。
如果在任何函数中的邻居是MPI_PROC_NULL,那么
该方向的邻域集合通信行为将类似于与MPI_PROC_NULL的点对点
通信。也就是说,缓冲区仍然是邻居序列的一部分,但既不会
进行通信也不会被更新。
17.2.260.6. 注意事项
对于此操作,sendbuf的MPI_IN_PLACE选项没有实际意义。
17.2.260.7. 错误
几乎所有MPI例程都会返回一个错误值;C语言例程通过函数返回值返回,Fortran例程则通过最后一个参数返回。
在返回错误值之前,会调用与通信对象(如通信器、窗口、文件)关联的当前MPI错误处理程序。如果MPI调用未关联任何通信对象,则该调用被视为附加到MPI_COMM_SELF,并将调用关联的MPI错误处理程序。当MPI_COMM_SELF未初始化时(即在MPI_Init/MPI_Init_thread之前、MPI_Finalize之后,或仅使用会话模型时),错误会触发初始错误处理程序。初始错误处理程序可通过在使用世界模型时调用MPI_Comm_set_errhandler来修改MPI_COMM_SELF,或通过mpiexec的mpi_initial_errhandler命令行参数,或MPI_Comm_spawn/MPI_Comm_spawn_multiple的info键来设置。如果未设置其他适当的错误处理程序,则MPI I/O函数将调用MPI_ERRORS_RETURN错误处理程序,而其他所有MPI函数将调用MPI_ERRORS_ABORT错误处理程序。
Open MPI 包含三个可使用的预定义错误处理器:
MPI_ERRORS_ARE_FATAL导致程序中止所有连接的MPI进程。MPI_ERRORS_ABORT一个可在通信器、窗口、文件或会话上调用的错误处理程序。当在通信器上调用时,其行为类似于在该通信器上调用MPI_Abort。如果在窗口或文件上调用,则行为类似于在包含对应窗口或文件中进程组的通信器上调用MPI_Abort。如果在会话上调用,则仅中止本地进程。MPI_ERRORS_RETURN向应用程序返回一个错误代码。
MPI应用程序也可以通过调用以下方式实现自己的错误处理程序:
请注意,MPI不保证MPI程序在出现错误后能够继续运行。
有关更多信息,请参阅MPI-3.1标准中的错误处理部分。