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平均路径长度

该文件是TPOT库的一部分。

当前版本的TPOT是由以下人员在Cedars-Sinai开发的： - Pedro Henrique Ribeiro (https://github.com/perib, https://www.linkedin.com/in/pedro-ribeiro/) - Anil Saini (anil.saini@cshs.org) - Jose Hernandez (jgh9094@gmail.com) - Jay Moran (jay.moran@cshs.org) - Nicholas Matsumoto (nicholas.matsumoto@cshs.org) - Hyunjun Choi (hyunjun.choi@cshs.org) - Miguel E. Hernandez (miguel.e.hernandez@cshs.org) - Jason Moore (moorejh28@gmail.com)

TPOT的原始版本主要由宾夕法尼亚大学的以下人员开发： - Randal S. Olson (rso@randalolson.com) - Weixuan Fu (weixuanf@upenn.edu) - Daniel Angell (dpa34@drexel.edu) - Jason Moore (moorejh28@gmail.com) - 以及许多慷慨的开源贡献者

TPOT 是免费软件：您可以根据自由软件基金会发布的 GNU 宽通用公共许可证的条款重新分发和/或修改它，许可证的版本可以是第 3 版，或者（根据您的选择）任何以后的版本。

TPOT 的发布是希望它能有用， 但没有任何保证；甚至没有对 适销性或特定用途适用性的暗示保证。更多详情请参阅 GNU 较宽松通用公共许可证。

您应该已经收到了一份GNU较宽松通用公共许可证的副本，随TPOT一起提供。如果没有，请参见http://www.gnu.org/licenses/。

average_path_length_objective(graph_pipeline)

计算从所有节点到根/最终估计器的平均最短路径（仅支持GraphPipeline）

参数:

名称 类型 描述 默认值
graph_pipeline

用于计算平均路径长度的管道

 required
Source code in tpot2/objectives/average_path_length.py 
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def average_path_length_objective(graph_pipeline):
    """
    Computes the average shortest path from all nodes to the root/final estimator (only supported for GraphPipeline)

    Parameters
    ----------
    graph_pipeline: GraphPipeline
        The pipeline to compute the average path length for

    """

    path_lengths =  nx.shortest_path_length(graph_pipeline.graph, source=graph_pipeline.root)
    return np.mean(np.array(list(path_lengths.values())))+1