Python 包介绍
本文档提供了 xgboost Python 包的基本概述。Python 包由三种不同的接口组成,包括原生接口、scikit-learn 接口和 dask 接口。有关 dask 接口的介绍,请参阅 使用 Dask 的分布式 XGBoost。
其他有用链接列表
目录
安装 XGBoost
要安装 XGBoost,请按照 安装指南 中的说明进行操作。
要验证您的安装,请在 Python 中运行以下命令:
import xgboost as xgb
数据接口
XGBoost Python 模块能够从多种不同类型的数据格式加载数据,包括 CPU 和 GPU 数据结构。有关支持的数据类型的完整列表,请参考 各种 XGBoost 函数支持的数据结构。有关文本输入格式的详细描述,请访问 DMatrix 的文本输入格式。
输入数据存储在一个 DMatrix
对象中。对于 sklearn 估计器接口,根据所选算法和输入,会创建一个 DMatrix
或 QuantileDMatrix
,详见 sklearn API 参考。我们将在这里用 DMatrix
说明一些基本输入类型。
要将一个 NumPy 数组加载到
DMatrix
中:data = np.random.rand(5, 10) # 5 entities, each contains 10 features label = np.random.randint(2, size=5) # binary target dtrain = xgb.DMatrix(data, label=label)
要将
scipy.sparse
数组加载到DMatrix
中:csr = scipy.sparse.csr_matrix((dat, (row, col))) dtrain = xgb.DMatrix(csr)
要将 Pandas 数据框加载到
DMatrix
中:data = pandas.DataFrame(np.arange(12).reshape((4,3)), columns=['a', 'b', 'c']) label = pandas.DataFrame(np.random.randint(2, size=4)) dtrain = xgb.DMatrix(data, label=label)
将
DMatrix
保存到 XGBoost 二进制文件中将加快加载速度:dtrain = xgb.DMatrix('train.svm.txt?format=libsvm') dtrain.save_binary('train.buffer')
在
DMatrix
构造函数中,缺失值可以用默认值替换:dtrain = xgb.DMatrix(data, label=label, missing=np.NaN)
在需要时可以设置权重:
w = np.random.rand(5, 1) dtrain = xgb.DMatrix(data, label=label, missing=np.NaN, weight=w)
在进行排名任务时,权重的数量应等于组的数量。
要将LIBSVM文本文件或XGBoost二进制文件加载到
DMatrix
中:dtrain = xgb.DMatrix('train.svm.txt?format=libsvm') dtest = xgb.DMatrix('test.svm.buffer')
XGBoost 中的解析器功能有限。在使用 Python 接口时,建议使用 sklearn 的
load_svmlight_file
或其他类似工具,而不是 XGBoost 的内置解析器。要将CSV文件加载到
DMatrix
中:# label_column specifies the index of the column containing the true label dtrain = xgb.DMatrix('train.csv?format=csv&label_column=0') dtest = xgb.DMatrix('test.csv?format=csv&label_column=0')
XGBoost 中的解析器功能有限。在使用 Python 接口时,建议使用 pandas 的
read_csv
或其他类似工具,而不是 XGBoost 的内置解析器。
各种 XGBoost 函数支持的数据结构
标记
T: 支持。
F: 不支持。
NE: 使用案例的类型无效。例如,pd.Series 不能作为多目标标签。
NPA: 在 numpy 数组的支持下提供帮助。
CPA: 在cupy数组的帮助下提供支持。
SciCSR: 在 scripy 稀疏 CSR 的帮助下提供支持。转换为 scipy CSR 可能是也可能是不可能的。如果转换失败,则引发类型错误。
FF: 如果需要,我们可以期待在不久的将来获得它的支持。
empty: 待填写。
表格标题
X 表示预测矩阵。
元信息:标签、权重等。
多标签:多目标的二维标签。
其他:我们未在此明确列出的任何内容,包括 lil、dia、bsr 等格式。XGBoost 将尝试将其转换为 scipy csr。
支持矩阵
名称 |
DMatrix X |
QuantileDMatrix X |
Sklearn X |
元信息 |
就地预测 |
多标签 |
---|---|---|---|---|---|---|
numpy.ndarray |
T |
T |
T |
T |
T |
T |
scipy.sparse.csr |
T |
T |
T |
NE |
T |
F |
scipy.sparse.csc |
T |
F |
T |
NE |
F |
F |
scipy.sparse.coo |
SciCSR |
F |
SciCSR |
NE |
F |
F |
uri |
T |
F |
F |
F |
NE |
F |
列表 |
NPA |
NPA |
NPA |
NPA |
NPA |
T |
元组 |
NPA |
NPA |
NPA |
NPA |
NPA |
T |
pandas.DataFrame |
NPA |
NPA |
NPA |
NPA |
NPA |
NPA |
pandas.Series |
NPA |
NPA |
NPA |
NPA |
NPA |
NE |
cudf.DataFrame |
T |
T |
T |
T |
T |
T |
cudf.Series |
T |
T |
T |
T |
FF |
NE |
cupy.ndarray |
T |
T |
T |
T |
T |
T |
torch.Tensor |
T |
T |
T |
T |
T |
T |
dlpack |
CPA |
CPA |
CPA |
FF |
FF |
|
datatable.Frame |
T |
FF |
NPA |
FF |
||
datatable.Table |
T |
FF |
NPA |
FF |
||
modin.DataFrame |
NPA |
FF |
NPA |
NPA |
FF |
|
modin.Series |
NPA |
FF |
NPA |
NPA |
FF |
|
pyarrow.Table |
NPA |
NPA |
NPA |
NPA |
NPA |
NPA |
__array__ |
NPA |
F |
NPA |
NPA |
H |
|
其他 |
SciCSR |
F |
F |
F |
设置参数
XGBoost 可以使用一对列表或字典来设置 参数。例如:
助推器参数
param = {'max_depth': 2, 'eta': 1, 'objective': 'binary:logistic'} param['nthread'] = 4 param['eval_metric'] = 'auc'
你也可以指定多个评估指标:
param['eval_metric'] = ['auc', 'ams@0'] # alternatively: # plst = param.items() # plst += [('eval_metric', 'ams@0')]
指定验证集以监控性能
evallist = [(dtrain, 'train'), (dtest, 'eval')]
训练
训练模型需要参数列表和数据集。
num_round = 10
bst = xgb.train(param, dtrain, num_round, evallist)
训练后,模型可以被保存。
bst.save_model('0001.model')
模型及其特征图也可以转储到文本文件中。
# dump model
bst.dump_model('dump.raw.txt')
# dump model with feature map
bst.dump_model('dump.raw.txt', 'featmap.txt')
保存的模型可以按如下方式加载:
bst = xgb.Booster({'nthread': 4}) # init model
bst.load_model('model.bin') # load model data
xgboost.Booster 中的 update 和 boost 方法仅用于内部使用。包装函数 xgboost.train 进行了一些预配置,包括设置缓存和其他参数。
早停
如果你有一个验证集,你可以使用早停法来找到最佳的提升轮数。早停法至少需要一个在 evals
中的集合。如果有多个,它将使用最后一个。
train(..., evals=evals, early_stopping_rounds=10)
模型将训练直到验证分数停止提高。验证错误需要至少每 early_stopping_rounds
减少一次以继续训练。
如果发生提前停止,模型将有两个额外的字段:bst.best_score
,bst.best_iteration
。注意,xgboost.train()
将返回最后一个迭代的模型,而不是最佳模型。
这适用于最小化的指标(如 RMSE、对数损失等)和最大化的指标(如 MAP、NDCG、AUC)。请注意,如果您指定了多个评估指标,param['eval_metric']
中的最后一个指标将用于提前停止。
预测
一个已经训练或加载的模型可以对数据集进行预测。
# 7 entities, each contains 10 features
data = np.random.rand(7, 10)
dtest = xgb.DMatrix(data)
ypred = bst.predict(dtest)
如果在训练期间启用了早停,您可以使用 bst.best_iteration
从最佳迭代中获取预测:
ypred = bst.predict(dtest, iteration_range=(0, bst.best_iteration + 1))
绘图
你可以使用绘图模块来绘制重要性和输出树。
要绘制重要性,请使用 xgboost.plot_importance()
。此函数需要安装 matplotlib
。
xgb.plot_importance(bst)
要通过 matplotlib
绘制输出树,请使用 xgboost.plot_tree()
,指定目标树的序号。此函数需要 graphviz
和 matplotlib
。
xgb.plot_tree(bst, num_trees=2)
当你使用 IPython
时,你可以使用 xgboost.to_graphviz()
函数,该函数将目标树转换为 graphviz
实例。graphviz
实例在 IPython
中会自动渲染。
xgb.to_graphviz(bst, num_trees=2)
Scikit-Learn 接口
XGBoost 提供了易于使用的 scikit-learn 接口,用于一些预定义的模型,包括回归、分类和排序。更多信息请参见 使用 Scikit-Learn 估计器接口。
# Use "hist" for training the model.
reg = xgb.XGBRegressor(tree_method="hist", device="cuda")
# Fit the model using predictor X and response y.
reg.fit(X, y)
# Save model into JSON format.
reg.save_model("regressor.json")
用户在需要时仍可以访问底层助推器模型:
booster: xgb.Booster = reg.get_booster()