入门指南

这个非常简单的案例研究旨在帮助您快速上手使用 statsmodels。从原始数据开始,我们将展示估计统计模型和绘制诊断图所需的步骤。我们将仅使用 statsmodels 或其 pandaspatsy 依赖项提供的函数。

加载模块和函数

安装 statsmodels 及其依赖项 之后,我们加载一些模块和函数:

In [1]: import statsmodels.api as sm

In [2]: import pandas

In [3]: from patsy import dmatrices

pandas 建立在 numpy 数组之上,提供了丰富的数据结构和数据分析工具。pandas.DataFrame 函数提供了带有标签的(可能是异构的)数据数组,类似于 R 中的“data.frame”。pandas.read_csv 函数可以用于将逗号分隔值文件转换为 DataFrame 对象。

patsy 是一个用于描述统计模型并使用类似于 R 公式的 Python 库,用于构建 设计矩阵

注意

此示例使用API接口。 有关导入API接口(statsmodels.apistatsmodels.tsa.api)与直接从定义模型的模块导入之间的区别,请参阅 导入路径和结构

数据

我们下载了Guerry数据集,这是一个用于支持André-Michel Guerry 1833年著作《法国道德统计论文》的历史数据集合。该数据集以逗号分隔值格式(CSV)在线托管于Rdatasets仓库中。我们可以将文件下载到本地,然后使用read_csv加载它,但pandas会自动为我们处理所有这些:

In [4]: df = sm.datasets.get_rdataset("Guerry", "HistData").data

The 输入/输出文档页面展示了如何从其他各种格式导入数据。

我们选择感兴趣的变量并查看最后5行:

In [5]: vars = ['Department', 'Lottery', 'Literacy', 'Wealth', 'Region']

In [6]: df = df[vars]

In [7]: df[-5:]
Out[7]: 
      Department  Lottery  Literacy  Wealth Region
81        Vienne       40        25      68      W
82  Haute-Vienne       55        13      67      C
83        Vosges       14        62      82      E
84         Yonne       51        47      30      C
85         Corse       83        49      37    NaN

请注意,区域列中有一个缺失的观测值。我们使用pandas提供的DataFrame方法来消除它:

In [8]: df = df.dropna()

In [9]: df[-5:]
Out[9]: 
      Department  Lottery  Literacy  Wealth Region
80        Vendee       68        28      56      W
81        Vienne       40        25      68      W
82  Haute-Vienne       55        13      67      C
83        Vosges       14        62      82      E
84         Yonne       51        47      30      C

实质动机与模型

我们想要了解1820年代法国86个部门的识字率是否与人均皇家彩票投注额相关。我们需要控制每个部门的财富水平,并且我们还希望在回归方程的右侧包括一系列虚拟变量,以控制由于地区效应引起的未观察到的异质性。该模型使用普通最小二乘回归(OLS)进行估计。

设计矩阵(endogexog

要拟合由 statsmodels 涵盖的大多数模型,您需要创建两个设计矩阵。第一个是内生变量(即因变量、响应变量、回归变量等)的矩阵。第二个是外生变量(即自变量、预测变量、回归变量等)的矩阵。OLS 系数估计值按常规计算:

\[\hat{\beta} = (X'X)^{-1} X'y\]

其中 \(y\) 是关于人均彩票投注数据的 \(N \times 1\) 列(彩票)。\(X\)\(N \times 7\),包含一个截距项、识字率财富变量,以及4个地区二元变量。

The patsy 模块提供了一个方便的函数,用于使用类似于 R 的公式准备设计矩阵。你可以在这里找到更多信息。

我们使用 patsydmatrices 函数来创建设计矩阵:

In [10]: y, X = dmatrices('Lottery ~ Literacy + Wealth + Region', data=df, return_type='dataframe')

生成的矩阵/数据框如下所示:

In [11]: y[:3]
Out[11]: 
   Lottery
0     41.0
1     38.0
2     66.0

In [12]: X[:3]
Out[12]: 
   Intercept  Region[T.E]  Region[T.N]  Region[T.S]  Region[T.W]  Literacy  Wealth
0        1.0          1.0          0.0          0.0          0.0      37.0    73.0
1        1.0          0.0          1.0          0.0          0.0      51.0    22.0
2        1.0          0.0          0.0          0.0          0.0      13.0    61.0

请注意,dmatrices 具有

  • 将分类变量区域拆分为一组指示变量。

  • 为外生回归变量矩阵添加了一个常数。

  • 返回的是 pandas DataFrame 而不是简单的 numpy 数组。这是有用的,因为 DataFrame 允许 statsmodels 在报告结果时保留元数据(例如变量名称)。

上述行为当然可以被改变。请参阅patsy文档页面

模型拟合与总结

statsmodels 中拟合模型通常涉及 3 个简单的步骤:

  1. 使用模型类来描述模型

  2. 使用类方法拟合模型

  3. 使用摘要方法检查结果

对于OLS,这是通过以下方式实现的:

In [13]: mod = sm.OLS(y, X)    # Describe model

In [14]: res = mod.fit()       # Fit model

In [15]: print(res.summary())   # Summarize model
                            OLS Regression Results                            
==============================================================================
Dep. Variable:                Lottery   R-squared:                       0.338
Model:                            OLS   Adj. R-squared:                  0.287
Method:                 Least Squares   F-statistic:                     6.636
Date:                   三, 16 10 2024   Prob (F-statistic):           1.07e-05
Time:                        18:43:04   Log-Likelihood:                -375.30
No. Observations:                  85   AIC:                             764.6
Df Residuals:                      78   BIC:                             781.7
Df Model:                           6                                         
Covariance Type:            nonrobust                                         
===============================================================================
                  coef    std err          t      P>|t|      [0.025      0.975]
-------------------------------------------------------------------------------
Intercept      38.6517      9.456      4.087      0.000      19.826      57.478
Region[T.E]   -15.4278      9.727     -1.586      0.117     -34.793       3.938
Region[T.N]   -10.0170      9.260     -1.082      0.283     -28.453       8.419
Region[T.S]    -4.5483      7.279     -0.625      0.534     -19.039       9.943
Region[T.W]   -10.0913      7.196     -1.402      0.165     -24.418       4.235
Literacy       -0.1858      0.210     -0.886      0.378      -0.603       0.232
Wealth          0.4515      0.103      4.390      0.000       0.247       0.656
==============================================================================
Omnibus:                        3.049   Durbin-Watson:                   1.785
Prob(Omnibus):                  0.218   Jarque-Bera (JB):                2.694
Skew:                          -0.340   Prob(JB):                        0.260
Kurtosis:                       2.454   Cond. No.                         371.
==============================================================================

Notes:
[1] Standard Errors assume that the covariance matrix of the errors is correctly specified.

对象 res 有许多有用的属性。例如,我们可以通过输入以下内容来提取参数估计值和决定系数:

In [16]: res.params
Out[16]: 
Intercept      38.651655
Region[T.E]   -15.427785
Region[T.N]   -10.016961
Region[T.S]    -4.548257
Region[T.W]   -10.091276
Literacy       -0.185819
Wealth          0.451475
dtype: float64

In [17]: res.rsquared
Out[17]: np.float64(0.3379508691928822)

输入 dir(res) 以获取完整的属性列表。

更多信息和示例,请参阅回归文档页面

诊断和规范测试

statsmodels 允许您进行一系列有用的 回归诊断和规范测试。例如, 应用Rainbow测试线性性(原假设是关系被正确地建模为线性):

In [18]: sm.stats.linear_rainbow(res)
Out[18]: (np.float64(0.847233997615691), np.float64(0.6997965543621644))

诚然,上面生成的输出并不十分详细,但通过阅读文档字符串 (同样,print(sm.stats.linear_rainbow.__doc__)),我们知道第一个数字是F统计量,第二个是p值。

statsmodels 还提供了图形功能。例如,我们可以通过以下方式绘制一组回归变量的偏回归图:

In [19]: sm.graphics.plot_partregress('Lottery', 'Wealth', ['Region', 'Literacy'],
   ....:                              data=df, obs_labels=False)
   ....: 
Out[19]: <Figure size 640x480 with 1 Axes>
_images/gettingstarted_0.png

文档

可以通过 IPython 会话访问文档,使用 webdoc

webdoc

打开浏览器并显示在线文档

更多

恭喜!您已准备好继续学习目录中的其他主题。


Last update: Oct 16, 2024