cdlib.evaluation.geometric_accuracy

cdlib.evaluation.geometric_accuracy(first_partition: object, second_partition: object) → MatchingResult

此函数计算两个（重叠）聚类之间的几何精度。

Parameters:

• first_partition – NodeClustering 对象

• second_partition – NodeClustering 对象

Returns:

匹配结果对象

Example:

>>> from cdlib import evaluation, algorithms
>>> import networkx as nx
>>> g = nx.karate_club_graph()
>>> louvain_communities = algorithms.louvain(g)
>>> leiden_communities = algorithms.leiden(g)
>>> evaluation.geometric_accuracy(louvain_communities,leiden_communities)

Reference:

Tamás Nepusz、Haiyuan Yu 和 Alberto Paccanaro。检测蛋白质-蛋白质相互作用网络中的重叠蛋白质复合物。《自然方法》，9(5):471–472，2012年。

注意

该函数需要安装clusim库。您可以通过pip安装：pip install clusim