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分析你的PyTorch模块

创建于:2020年12月30日 | 最后更新:2024年1月19日 | 最后验证:2024年11月5日

作者: Suraj Subramanian

PyTorch 包含一个分析器 API,可用于识别代码中各种 PyTorch 操作的时间和内存成本。分析器可以轻松集成到您的代码中,结果可以以表格形式打印或以 JSON 跟踪文件形式返回。

注意

分析器支持多线程模型。分析器在与操作相同的线程中运行,但它也会分析可能在另一个线程中运行的子操作符。并发运行的分析器将被限定在自己的线程中,以防止结果混淆。

注意

PyTorch 1.8 引入了新的 API,将在未来的版本中取代旧的 profiler API。请查看此页面以了解新 API。

前往此配方以快速了解Profiler API的使用方法。


import torch
import numpy as np
from torch import nn
import torch.autograd.profiler as profiler

使用Profiler进行性能调试

分析器对于识别模型中的性能瓶颈非常有用。在这个例子中,我们构建了一个自定义模块,该模块执行两个子任务:

  • 对输入进行线性变换,并且

  • 使用转换结果获取掩码张量上的索引。

我们使用profiler.record_function("label")将每个子任务的代码包装在单独的标记上下文管理器中。在分析器输出中,子任务中所有操作的聚合性能指标将显示在其对应的标签下。

请注意,使用Profiler会产生一些开销,最好仅用于调查代码。如果您正在对运行时间进行基准测试,请记得将其移除。

class MyModule(nn.Module):
    def __init__(self, in_features: int, out_features: int, bias: bool = True):
        super(MyModule, self).__init__()
        self.linear = nn.Linear(in_features, out_features, bias)

    def forward(self, input, mask):
        with profiler.record_function("LINEAR PASS"):
            out = self.linear(input)

        with profiler.record_function("MASK INDICES"):
            threshold = out.sum(axis=1).mean().item()
            hi_idx = np.argwhere(mask.cpu().numpy() > threshold)
            hi_idx = torch.from_numpy(hi_idx).cuda()

        return out, hi_idx

分析前向传播

我们初始化随机输入和掩码张量,以及模型。

在我们运行分析器之前,我们预热CUDA以确保准确的性能基准测试。我们将模块的前向传递包装在profiler.profile上下文管理器中。with_stack=True参数在跟踪中附加操作的文件和行号。

警告

with_stack=True 会产生额外的开销,更适合用于调查代码。 如果您正在进行性能基准测试,请记得移除它。

model = MyModule(500, 10).cuda()
input = torch.rand(128, 500).cuda()
mask = torch.rand((500, 500, 500), dtype=torch.double).cuda()

# warm-up
model(input, mask)

with profiler.profile(with_stack=True, profile_memory=True) as prof:
    out, idx = model(input, mask)

提高内存性能

请注意,就内存和时间而言,最昂贵的操作是在forward (10)处,代表MASK INDICES内的操作。让我们首先尝试解决内存消耗问题。我们可以看到第12行的.to()操作消耗了953.67 Mb。此操作将mask复制到CPU。mask是用torch.double数据类型初始化的。我们是否可以通过将其转换为torch.float来减少内存占用?

model = MyModule(500, 10).cuda()
input = torch.rand(128, 500).cuda()
mask = torch.rand((500, 500, 500), dtype=torch.float).cuda()

# warm-up
model(input, mask)

with profiler.profile(with_stack=True, profile_memory=True) as prof:
    out, idx = model(input, mask)

print(prof.key_averages(group_by_stack_n=5).table(sort_by='self_cpu_time_total', row_limit=5))

"""
(Some columns are omitted)

-----------------  ------------  ------------  ------------  --------------------------------
             Name    Self CPU %      Self CPU  Self CPU Mem   Source Location
-----------------  ------------  ------------  ------------  --------------------------------
     MASK INDICES        93.61%        5.006s    -476.84 Mb  /mnt/xarfuse/.../torch/au
                                                             <ipython-input-...>(10): forward
                                                             /mnt/xarfuse/  /torch/nn
                                                             <ipython-input-...>(9): <module>
                                                             /mnt/xarfuse/.../IPython/

      aten::copy_         6.34%     338.759ms           0 b  <ipython-input-...>(12): forward
                                                             /mnt/xarfuse/.../torch/nn
                                                             <ipython-input-...>(9): <module>
                                                             /mnt/xarfuse/.../IPython/
                                                             /mnt/xarfuse/.../IPython/

 aten::as_strided         0.01%     281.808us           0 b  <ipython-input-...>(11): forward
                                                             /mnt/xarfuse/.../torch/nn
                                                             <ipython-input-...>(9): <module>
                                                             /mnt/xarfuse/.../IPython/
                                                             /mnt/xarfuse/.../IPython/

      aten::addmm         0.01%     275.721us           0 b  /mnt/xarfuse/.../torch/nn
                                                             /mnt/xarfuse/.../torch/nn
                                                             /mnt/xarfuse/.../torch/nn
                                                             <ipython-input-...>(8): forward
                                                             /mnt/xarfuse/.../torch/nn

      aten::_local        0.01%     268.650us           0 b  <ipython-input-...>(11): forward
      _scalar_dense                                          /mnt/xarfuse/.../torch/nn
                                                             <ipython-input-...>(9): <module>
                                                             /mnt/xarfuse/.../IPython/
                                                             /mnt/xarfuse/.../IPython/

-----------------  ------------  ------------  ------------  --------------------------------
Self CPU time total: 5.347s

"""

此操作的CPU内存占用减少了一半。

提高时间性能

虽然消耗的时间也有所减少,但仍然太高。 事实证明,将矩阵从CUDA复制到CPU是非常昂贵的! aten::copy_ 操作符在 forward (12) 中将 mask 复制到CPU, 以便可以使用NumPy的 argwhere 函数。aten::copy_forward(13) 中 将数组作为张量复制回CUDA。如果我们在这里使用 torchnonzero() 函数,就可以消除这两个操作。

class MyModule(nn.Module):
    def __init__(self, in_features: int, out_features: int, bias: bool = True):
        super(MyModule, self).__init__()
        self.linear = nn.Linear(in_features, out_features, bias)

    def forward(self, input, mask):
        with profiler.record_function("LINEAR PASS"):
            out = self.linear(input)

        with profiler.record_function("MASK INDICES"):
            threshold = out.sum(axis=1).mean()
            hi_idx = (mask > threshold).nonzero(as_tuple=True)

        return out, hi_idx


model = MyModule(500, 10).cuda()
input = torch.rand(128, 500).cuda()
mask = torch.rand((500, 500, 500), dtype=torch.float).cuda()

# warm-up
model(input, mask)

with profiler.profile(with_stack=True, profile_memory=True) as prof:
    out, idx = model(input, mask)

print(prof.key_averages(group_by_stack_n=5).table(sort_by='self_cpu_time_total', row_limit=5))

"""
(Some columns are omitted)

--------------  ------------  ------------  ------------  ---------------------------------
          Name    Self CPU %      Self CPU  Self CPU Mem   Source Location
--------------  ------------  ------------  ------------  ---------------------------------
      aten::gt        57.17%     129.089ms           0 b  <ipython-input-...>(12): forward
                                                          /mnt/xarfuse/.../torch/nn
                                                          <ipython-input-...>(25): <module>
                                                          /mnt/xarfuse/.../IPython/
                                                          /mnt/xarfuse/.../IPython/

 aten::nonzero        37.38%      84.402ms           0 b  <ipython-input-...>(12): forward
                                                          /mnt/xarfuse/.../torch/nn
                                                          <ipython-input-...>(25): <module>
                                                          /mnt/xarfuse/.../IPython/
                                                          /mnt/xarfuse/.../IPython/

   INDEX SCORE         3.32%       7.491ms    -119.21 Mb  /mnt/xarfuse/.../torch/au
                                                          <ipython-input-...>(10): forward
                                                          /mnt/xarfuse/.../torch/nn
                                                          <ipython-input-...>(25): <module>
                                                          /mnt/xarfuse/.../IPython/

aten::as_strided         0.20%    441.587us          0 b  <ipython-input-...>(12): forward
                                                          /mnt/xarfuse/.../torch/nn
                                                          <ipython-input-...>(25): <module>
                                                          /mnt/xarfuse/.../IPython/
                                                          /mnt/xarfuse/.../IPython/

 aten::nonzero
     _numpy             0.18%     395.602us           0 b  <ipython-input-...>(12): forward
                                                          /mnt/xarfuse/.../torch/nn
                                                          <ipython-input-...>(25): <module>
                                                          /mnt/xarfuse/.../IPython/
                                                          /mnt/xarfuse/.../IPython/
--------------  ------------  ------------  ------------  ---------------------------------
Self CPU time total: 225.801ms

"""

进一步阅读

我们已经了解了如何使用Profiler来调查PyTorch模型中的时间和内存瓶颈。 在这里阅读更多关于Profiler的信息:

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