DtwPythonDist#
- class DtwPythonDist(dist='euclidean', step_pattern='symmetric2', window_type='none', open_begin=False, open_end=False)[源代码][源代码]#
dtw-python 包中动态时间规整距离的接口。
使用 dtw-python 包计算序列之间的动态时间规整距离。
- 参数:
- dist: str, 或遵循 sktime BasePairwiseTransformer API 的估计器
使用的距离,实数 n 空间的距离,默认 = “euclidean” 如果是字符串,必须是
scipy.spatial.distance.cdist中的函数名称 如果是估计器,必须遵循 sktime BasePairwiseTransformer API- step_patternstr, 可选, 默认 = “symmetric2”,
或者 dtw_python 步模式对象,可选的步模式用于时间规整,可以是以下之一:’symmetric1’, ‘symmetric2’(默认), ‘asymmetric’,以及几十种其他更非标准的步模式;可以通过调用 help(stepPattern) 来显示列表。
- window_type: str 可选, 默认 = “none”
所选的窗口函数 “none”, “itakura”, “sakoechiba”, 或 “slantedband” “none” (默认) - 无窗口 “sakoechiba” - 主对角线周围的带 “slantedband” - 倾斜对角线周围的带 “itakura” - Itakura 平行四边形
- 开始打开布尔值,可选,默认=False
- open_end: boolean, 可选, 默认=False
是否执行开放式对齐 open_begin = 对齐是否在开始时开放(低索引) open_end = 对齐是否在结束时开放(高索引)
- 属性:
is_fitted是否已调用
fit。
方法
__call__(X[, X2])计算距离/核矩阵,调用简写。
检查估计器是否已被拟合。
clone()获取一个具有相同超参数的对象副本。
clone_tags(estimator[, tag_names])从另一个估计器克隆标签作为动态覆盖。
create_test_instance([parameter_set])如果可能,构造 Estimator 实例。
create_test_instances_and_names([parameter_set])创建所有测试实例的列表及其名称列表。
fit([X, X2])接口兼容的拟合方法(内部无逻辑)。
get_class_tag(tag_name[, tag_value_default])获取类标签的值。
从类及其所有父类中获取类标签。
获取 self 的配置标志
get_fitted_params([deep])获取拟合参数。
获取对象的参数默认值。
get_param_names([sort])获取对象的参数名称。
get_params([deep])获取此对象的参数值字典。
get_tag(tag_name[, tag_value_default, ...])从估计器类获取标签值和动态标签覆盖。
get_tags()从估计器类和动态标签覆盖中获取标签。
get_test_params([parameter_set])返回估计器的测试参数设置。
检查对象是否由其他 BaseObjects 组成。
load_from_path(serial)从文件位置加载对象。
load_from_serial(serial)从序列化的内存容器中加载对象。
reset()将对象重置为初始化后的干净状态。
save([path, serialization_format])将序列化的自身保存到类字节对象或(.zip)文件中。
set_config(**config_dict)将配置标志设置为给定值。
set_params(**params)设置此对象的参数。
set_random_state([random_state, deep, ...])设置 random_state 伪随机种子参数为 self。
set_tags(**tag_dict)将动态标签设置为给定值。
transform(X[, X2])计算距离/核矩阵。
计算距离/核矩阵的对角线。
- classmethod get_test_params(parameter_set='default')[源代码][源代码]#
返回估计器的测试参数设置。
- 参数:
- 参数集str, 默认值=”default”
要返回的测试参数集的名称,用于测试中。如果没有为某个值定义特殊参数,将返回
"default"集。目前没有为距离/核变换器保留的值。
- 返回:
- 参数dict 或 dict 的列表,默认 = {}
创建类的测试实例的参数 每个字典都是构造一个“有趣”的测试实例的参数,即
MyClass(**params)或MyClass(**params[i])创建一个有效的测试实例。create_test_instance使用params中的第一个(或唯一一个)字典
- clone()[源代码]#
获取一个具有相同超参数的对象副本。
克隆是一个在初始化后状态下的不同对象,没有共享引用。此函数等同于返回 self 的 sklearn.clone。
- 引发:
- 如果克隆不符合规范,由于
__init__存在错误,则会引发 RuntimeError。
- 如果克隆不符合规范,由于
注释
如果成功,值等于
type(self)(**self.get_params(deep=False))。
- clone_tags(estimator, tag_names=None)[源代码]#
从另一个估计器克隆标签作为动态覆盖。
- 参数:
- 估计器继承自
BaseEstimator的估计器 - 标签名称str 或 str 列表, 默认 = None
要克隆的标签名称。如果为 None,则使用估计器中的所有标签作为 tag_names。
- 估计器继承自
- 返回:
- 自我
自我引用。
注释
通过在 tag_set 中设置标签值,从估计器中将标签作为动态标签设置到 self 的对象状态中。
- classmethod create_test_instance(parameter_set='default')[源代码]#
如果可能,构造 Estimator 实例。
- 参数:
- 参数集str, 默认值=”default”
要返回的测试参数集的名称,用于测试。如果没有为某个值定义特殊参数,将返回 “default” 集。
- 返回:
- 实例使用默认参数的类实例
注释
get_test_params 可以返回字典或字典列表。此函数获取 get_test_params 返回的第一个或单个字典,并用该字典构建对象。
- classmethod create_test_instances_and_names(parameter_set='default')[源代码]#
创建所有测试实例的列表及其名称列表。
- 参数:
- 参数集str, 默认值=”default”
要返回的测试参数集的名称,用于测试。如果没有为某个值定义特殊参数,将返回 “default” 集。
- 返回:
- objscls 的实例列表
第 i 个实例是 cls(**cls.get_test_params()[i])
- 名称list of str, 与 objs 长度相同
第 i 个元素是测试中第 i 个 obj 实例的名称,约定为 {cls.__name__}-{i} 如果存在多个实例,否则为 {cls.__name__}
- classmethod get_class_tag(tag_name, tag_value_default=None)[源代码]#
获取类标签的值。
不返回在实例上定义的动态标签(通过 set_tags 或 clone_tags 设置)的信息。
- 参数:
- 标签名称str
标签值的名称。
- tag_value_default任何
如果未找到标签,则使用默认/回退值。
- 返回:
- 标签值
在 self 中 tag_name 标签的值。如果未找到,则返回 tag_value_default。
- classmethod get_class_tags()[源代码]#
从类及其所有父类中获取类标签。
从 _tags 类属性中检索标签:值对。不返回在实例上通过 set_tags 或 clone_tags 设置的动态标签信息。
- 返回:
- collected_tagsdict
类标签名称字典:标签值对。通过嵌套继承从 _tags 类属性中收集。
- get_config()[源代码]#
获取 self 的配置标志
- 返回:
- config_dictdict
配置名称 : 配置值对的字典。通过嵌套继承从 _config 类属性收集,然后从 _config_dynamic 对象属性中覆盖和新标签。
- get_fitted_params(deep=True)[源代码]#
获取拟合参数。
- 状态要求:
需要状态为“已拟合”。
- 参数:
- 深度bool, 默认=True
是否返回组件的拟合参数。
如果为真,将返回此对象的参数名称 : 值的字典,包括可拟合组件的拟合参数(= BaseEstimator 值的参数)。
如果为 False,将返回此对象的参数名称 : 值的字典,但不包括组件的拟合参数。
- 返回:
- fitted_params带有字符串键的字典
拟合参数的字典,paramname : paramvalue 键值对包括:
always: 该对象的所有拟合参数,通过
get_param_names获取的值是该对象对应键的拟合参数值。如果
deep=True,还包含组件参数的键/值对,组件的参数被索引为[componentname]__[paramname],所有componentname的参数都以paramname的形式出现,并带有其值。如果
deep=True,还包含任意层级的组件递归,例如,[componentname]__[componentcomponentname]__[paramname],等等。
- classmethod get_param_defaults()[源代码]#
获取对象的参数默认值。
- 返回:
- default_dict: dict[str, Any]
键是 cls 中在 __init__ 中定义了默认值的所有参数,值是 __init__ 中定义的默认值。
- classmethod get_param_names(sort=True)[源代码]#
获取对象的参数名称。
- 参数:
- 排序bool, 默认=True
是否按字母顺序返回参数名称(True),或者按它们在类
__init__中出现的顺序返回(False)。
- 返回:
- param_names: list[str]
cls 的参数名称列表。如果
sort=False,则按它们在类__init__中出现的顺序排列。如果sort=True,则按字母顺序排列。
- get_params(deep=True)[源代码]#
获取此对象的参数值字典。
- 参数:
- 深度bool, 默认=True
是否返回组件的参数。
如果为 True,将返回此对象的参数名称 : 值的字典,包括组件的参数(= BaseObject 值的参数)。
如果为 False,将返回此对象的参数名称 : 值的字典,但不包括组件的参数。
- 返回:
- 参数带有字符串键的字典
参数的字典,paramname : paramvalue 键值对包括:
总是:此对象的所有参数,通过 get_param_names 获取的值是该键的参数值,此对象的值始终与构造时传递的值相同。
如果 deep=True,还包含组件参数的键/值对,组件的参数被索引为 [componentname]__[paramname],所有 componentname 的参数都以其值的形式显示为 paramname。
如果 deep=True,还包含任意级别的组件递归,例如,[componentname]__[componentcomponentname]__[paramname] 等。
- get_tag(tag_name, tag_value_default=None, raise_error=True)[源代码]#
从估计器类获取标签值和动态标签覆盖。
- 参数:
- 标签名称str
要检索的标签名称
- tag_value_default任何类型,可选;默认=None
如果未找到标签,则使用默认/回退值
- raise_error布尔
当标签未找到时是否引发 ValueError
- 返回:
- tag_value任何
在 self 中 tag_name 标签的值。如果未找到,当 raise_error 为 True 时返回错误,否则返回 tag_value_default。
- 引发:
- 如果 raise_error 为 True,即如果 tag_name 不在其中,则引发 ValueError。
- self.get_tags().keys()
- get_tags()[源代码]#
从估计器类和动态标签覆盖中获取标签。
- 返回:
- collected_tagsdict
标签名称 : 标签值对的字典。通过嵌套继承收集自 _tags 类属性,然后是 _tags_dynamic 对象属性的任何覆盖和新标签。
- is_composite()[源代码]#
检查对象是否由其他 BaseObjects 组成。
复合对象是一个包含对象的对象,作为参数。在实例上调用,因为这可能因实例而异。
- 返回:
- composite: bool
一个对象是否具有任何值为 BaseObjects 的参数。
- classmethod load_from_path(serial)[源代码]#
从文件位置加载对象。
- 参数:
- 串行ZipFile(path).open(“object”) 的结果
- 返回:
- 反序列化自身,结果输出到
path,通过cls.save(path)
- 反序列化自身,结果输出到
- classmethod load_from_serial(serial)[源代码]#
从序列化的内存容器中加载对象。
- 参数:
- serial :
cls.save(None)输出的第一个元素输出结果的第一个元素
- serial :
- 返回:
- 反序列化自身,结果输出为
serial,来自cls.save(None)
- 反序列化自身,结果输出为
- reset()[源代码]#
将对象重置为初始化后的干净状态。
使用 reset,使用超参数的当前值(get_params 的结果)运行 __init__。这将移除任何对象属性,除了:
超参数 = __init__ 的参数
包含双下划线的对象属性,即字符串”__”
类和对象方法,以及类属性也不受影响。
- 返回:
- 自身
类的实例重置为干净的初始化后状态,但保留当前的超参数值。
注释
等同于 sklearn.clone,但会覆盖 self。在调用 self.reset() 后,self 的值等于 type(self)(**self.get_params(deep=False))
- save(path=None, serialization_format='pickle')[源代码]#
将序列化的自身保存到类字节对象或(.zip)文件中。
行为:如果
path为 None,则返回内存中的序列化自身;如果path是一个文件位置,则将自身存储在该位置作为一个 zip 文件。保存的文件是包含以下内容的zip文件:_metadata - 包含自身的类,即 type(self) _obj - 序列化的自身。此类使用默认的序列化(pickle)。
- 参数:
- 路径无或文件位置(字符串或路径)
如果为 None,则将 self 保存到内存对象中;如果为文件位置,则将 self 保存到该文件位置。如果:
path=”estimator” 则会在当前工作目录(cwd)生成一个名为
estimator.zip的压缩文件。path=”/home/stored/estimator” 则会在/home/stored/目录下存储一个名为estimator.zip的压缩文件。- serialization_format: str, default = “pickle”
用于序列化的模块。可用的选项是 “pickle” 和 “cloudpickle”。请注意,非默认格式可能需要安装其他软依赖项。
- 返回:
- 如果
path为 None - 内存中序列化的 self - 如果
path是文件位置 - 带有文件引用的 ZipFile
- 如果
- set_config(**config_dict)[源代码]#
将配置标志设置为给定值。
- 参数:
- config_dictdict
配置名称 : 配置值对的字典。有效的配置、值及其含义如下所示:
- 显示str, “diagram” (默认), 或 “text”
jupyter 内核如何显示 self 的实例
“diagram” = html 盒子图表示
“text” = 字符串打印输出
- print_changed_onlybool, 默认=True
是否仅打印与默认值不同的自身参数(False),或打印所有参数名称和值(False)。不嵌套,即仅影响自身,不影响组件估计器。
- 警告str, “on” (默认), 或 “off”
是否引发警告,仅影响来自 sktime 的警告
“on” = 将引发来自 sktime 的警告
“off” = 不会从 sktime 引发警告
- 后端:并行str, 可选, 默认=”None”
在广播/矢量化时用于并行化的后端,是以下之一
“None”: 按顺序执行循环,简单的列表推导
“loky”, “multiprocessing” 和 “threading”: 使用
joblib.Parallel“joblib”:自定义和第三方
joblib后端,例如spark“dask”:使用
dask,需要在环境中安装dask包
- backend:parallel:paramsdict, 可选, 默认={} (未传递参数)
传递给并行化后端的额外参数作为配置。有效键取决于
backend:parallel的值:“None”: 没有额外参数,
backend_params被忽略“loky”, “multiprocessing” 和 “threading”: 默认
joblib后端 任何有效的joblib.Parallel键都可以在这里传递,例如n_jobs,除了backend直接由backend控制。如果未传递n_jobs,它将默认为-1,其他参数将默认为joblib默认值。“joblib”:自定义和第三方
joblib后端,例如spark。任何joblib.Parallel的有效键都可以在这里传递,例如n_jobs,在这种情况下,backend必须作为backend_params的键传递。如果未传递n_jobs,它将默认为-1,其他参数将默认为joblib的默认值。dask: 任何dask.compute的有效键都可以传递,例如scheduler
- 返回:
- self自我引用。
注释
更改对象状态,将 config_dict 中的配置复制到 self._config_dynamic。
- set_params(**params)[源代码]#
设置此对象的参数。
该方法适用于简单的估计器以及复合对象。参数键字符串
<component>__<parameter>可以用于复合对象,即包含其他对象的对象,以访问组件<component>中的<parameter>。如果没有<component>__,字符串<parameter>也可以使用,前提是这使得引用明确,例如,没有两个组件的参数名称都是<parameter>。- 参数:
- **参数dict
BaseObject 参数,键必须是
<组件>__<参数>字符串。如果 get_params 键中唯一,__ 后缀可以别名为完整字符串。
- 返回:
- self引用自身(在参数设置之后)
- set_random_state(random_state=None, deep=True, self_policy='copy')[源代码]#
设置 random_state 伪随机种子参数为 self。
通过
estimator.get_params查找名为random_state的参数,并通过set_params将其设置为由random_state派生的整数。这些整数通过sample_dependent_seed的链哈希采样获得,并保证种子随机生成器的伪随机独立性。根据
self_policy应用于estimator中的random_state参数,并且仅当deep=True时应用于剩余的组件估计器。注意:即使
self没有random_state,或者没有任何组件有random_state参数,也会调用set_params。因此,set_random_state将重置任何scikit-base估计器,即使它们没有random_state参数。- 参数:
- random_stateint, RandomState 实例或 None, 默认=None
伪随机数生成器,用于控制随机整数的生成。传递整数以在多次函数调用中获得可重复的输出。
- 深度bool, 默认=True
是否在子估计器中设置随机状态。如果为 False,则仅设置
self的random_state参数(如果存在)。如果为 True,则还会在子估计器中设置random_state参数。- self_policystr, 可以是 {“copy”, “keep”, “new”} 之一, 默认=”copy”
“复制” :
estimator.random_state被设置为输入random_state“保持” :
estimator.random_state保持不变“new” :
estimator.random_state被设置为一个新随机状态,
派生自输入
random_state,并且通常与它不同。
- 返回:
- self自我引用
- set_tags(**tag_dict)[源代码]#
将动态标签设置为给定值。
- 参数:
- **标签字典dict
标签名称:标签值对的字典。
- 返回:
- 自我
自我引用。
注释
通过在 tag_dict 中设置标签值,将对象状态更改为 self 中的动态标签。
- transform(X, X2=None)[源代码]#
计算距离/核矩阵。
- 行为:返回成对距离/核矩阵
在 X 和 X2 样本之间(如果未传递,则等于 X)
- 参数:
- XSeries 或 Panel,任何支持的 mtype,n 个实例
- 要转换的数据,其Python类型如下:
系列: pd.Series, pd.DataFrame, 或 np.ndarray (1D 或 2D) 面板: 具有 2 级 MultiIndex 的 pd.DataFrame, pd.DataFrame 列表,
嵌套的 pd.DataFrame,或长/宽格式的 pd.DataFrame
- 遵循 sktime mtype 格式规范,更多详情请参见
examples/AA_datatypes_and_datasets.ipynb
- X2系列或面板,任何支持的 mtype,m 个实例
可选,默认值:X = X2
- 要转换的数据,其Python类型如下:
系列: pd.Series, pd.DataFrame, 或 np.ndarray (1D 或 2D) 面板: 具有 2 级 MultiIndex 的 pd.DataFrame, pd.DataFrame 列表,
嵌套的 pd.DataFrame,或长/宽格式的 pd.DataFrame
- 遵循 sktime mtype 格式规范,更多详情请参见
examples/AA_datatypes_and_datasets.ipynb
X 和 X2 不需要具有相同的 mtype
- 返回:
- distmat: 形状为 [n, m] 的 np.array
(i,j)-th 条目包含 X[i] 和 X2[j] 之间的距离/核
- transform_diag(X)[源代码]#
计算距离/核矩阵的对角线。
行为:返回 X 中样本的距离/核矩阵的对角线
- 参数:
- XSeries 或 Panel,任何支持的 mtype,n 个实例
- 要转换的数据,其Python类型如下:
系列: pd.Series, pd.DataFrame, 或 np.ndarray (1D 或 2D) 面板: 具有 2 级 MultiIndex 的 pd.DataFrame, pd.DataFrame 列表,
嵌套的 pd.DataFrame,或长/宽格式的 pd.DataFrame
- 遵循 sktime mtype 格式规范,更多详情请参见
examples/AA_datatypes_and_datasets.ipynb
- 返回:
- diag: 形状为 [n] 的 np.array
第 i 个条目包含 X[i] 和 X[i] 之间的距离/核